车身侧面，双腰线的设计勾勒出SUV具备的力量感，上半部分腰线分为两段式，下半部分隐藏e-tron的LOGO，整个车身有奥迪SUV车型的圆润动感与力量感。尺寸方面，新车长宽高分别为4771/1993/1648mm，轴距为2899mm，定位中型纯电SUV。车辆尾部，D柱微微向前倾斜，同时车顶微微下压，营造出更流畅的身姿。与前日行灯一样，车辆尾部的OLED尾灯同样可以变换样式，尾灯采用贯穿式的设计。
相比于目前国产在售的奥迪车型，奥迪Q6 e-tron更像是另一个时代的产品，其内饰设计采用全新布局，与奥迪e-tron、奥迪Q5 e-tron等电动化车型均不相同，Q6 e-tron采用全新的布局，14.5英寸多媒体曲面屏、11.9英寸的虚拟座舱以及10.9英寸的副驾驶屏幕共同组成车内的屏幕，还提供AR-HUD抬头显示系统，可显示车速、交通标志、导航等相关信息，整体的科技氛围提升不少。
为了不影响仪表盘的视觉，方向盘上的按键采用触摸式控制。主驾车门处集成了更多的按键，包括灯光、座椅记忆、门锁、后视镜等，以方便驾驶员操作。此外，可以明显感受到物流按键减少了，这也是当前电动车设计的一大趋势。其它设计方面，奥迪Q6 e-tron前排中控扶手区提供两个杯架、1个手机充电储物槽以及两个USB Type-C充电接口，储物空间还是相对可以的。新车使用拨杆式换挡机构，并保留少数如驾驶模式切换、ESP启闭、音量调节、倒车辅助影像等快捷键，