内饰是尤其的不一样——特殊的仪表台造型，不仔细看都不知道空调出风口和扬声器面罩分别位于哪里，同时也使得E100在有限的成本内无法提供副驾驶座安全气囊。此外宝骏E100在成本工程上也有一些独特的思考，比如空调取消了吹脚功能，但无论是制冷还是制热（制热为PTC），空调的性能都是令人满意的。
宝骏E100的内饰几乎所有的按键都有背光，这在10万以下的自主车型中其实相当少见。车内阅读灯的亮度也特别高。娱乐系统则由一个特殊的Pad实现，但试驾车并未提供这个Pad，所以功能不得而知，只是知道这款车还配备了倒车影像。
宝骏E100只有一排(两个)座椅，座椅只提供前后向调节，甚至不具有椅背倾角的调节。不过仔细一想也不奇怪，为了有利于舒适性且增加空间的开阔感，宝骏E100将座椅尽可能靠近后桥布置，此时其实行李箱空间都已不大，即便增加椅背倾角调节也不能提供太大的调节范围。E100的内饰颜色非常亮眼，大面积白色加上少数橙色的装饰，包括安全带也是橙色的，车门拉手及车顶的拉手都是橙色的皮质带子，座椅也是以白色为主橙色为辅（试驾车配备了座椅套），相当好看，只是在阳光比较强烈时，仪表台在前挡风玻璃上的反光有点影响视野。