相比于外观的设计优化，新IS内饰的变化则相对平淡，整体依然延续了现款IS的布局，只是在科技配置方面进行了一些相应的补足。比如升级标配了8.0英寸触摸屏，而在高配车型中还可选装更大尺寸的10.3英寸触摸屏。内置系统也可以兼容诸如Apple CarPlay，Android Auto和Amazon Alexa的第三方软件。
中央通道的功能按键布局进行了布局上的调整，挡杆右侧为驾驶模式功能旋钮以及ESP等驾驶辅助功能按键，而在挡杆后方则为雷克萨斯特有的触摸板。此外，水杯槽的位置也进行了前移，存取更加便捷合理。
座椅方面，雷克萨斯依旧采用NuLuxe环保仿真皮革和织物拼接的运动型座椅，主驾驶位带有10向电动调节功能。而在F SPORT车型上，雷克萨斯还针对每扇车门都采用新的图形装饰，包括带有浮雕工艺雕刻的图形图案，展现出雷克萨斯内饰Takumi（匠人）工艺的一种新形式。
材质方面，新款IS首次使用黑色金属漆装饰，不过仅限于F SPORT车型上独有。钢琴烤漆的黑色亮面增加了车内装饰的豪华质感，配合带触摸感应的双区域自动空调控制系统，在运动的F SPORT车中也能找到端庄典雅的用车体验。