每次开车行驶3公里对车辆本身并不会造成损害。无论行驶的距离长短，只要正常驾驶、不超速、不超载，并且注意保养和维护，车辆都能够正常运行。然而，如果频繁短距离行驶，比如每次只有几公里，可能会导致发动机和变速箱的某些部件磨损稍微加快一些，因为车辆尚未充分热机就到达目的地了。除此之外，短距离行驶还可能增加油耗和排放，因为冷机启动时的燃油消耗相对较高。所以，尽管每次开车行驶3公里不会对车辆造成严重损害，但频繁短距离行驶可能会带来一些轻微的影响。为了确保车辆的正常运行和延长使用寿命，建议适当延长行驶距离并定期进行保养。