是的，有影响的。长时间停车时，如果发动机未关闭而空调系统仍在运行，会增加发动机的负荷，可能导致发动机过热、磨损加剧等问题。此外，空调系统的制冷剂也会因为长时间的低压工作而减少，影响空调系统的性能和寿命。因此，建议停车时尽量关闭空调系统并关闭发动机。