是的，高速公路上占用应急车道行驶会被扣分。 根据《中华人民共和国道路交通安全法》和《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的规定，机动车在高速公路上不按规定车道行驶的，或者非紧急情况时在应急车道行驶的，可以罚款200元并扣3分。所以，如果你不小心在应急车道行驶了，可能会被扣分并处罚款。