20周年纪念版前杠比原厂设计更复杂，提供更多空气动力学元素，看上去也更现代化。侧面维持原厂，除了翼子板上的“S2000R”字样，并没有加装其他改件。轮圈选择了双五幅式的设计，并喷上标志性的冠军白，外观也同样使用这个配色。
从敞篷机构来判断似乎是以CR为基础，并没有使用了普通版的可折叠半自动软顶，并且对防滚架的盖板的颜色进行修改。
后期版AP2的尾灯设计非常漂亮，可以看到内部带有LED光源，相比起AP1的卤素尾灯无论在观感还是点亮效果上都要更优胜。其余部分也维持原厂，尾翼使用了本田御用改装厂无限的改件，尾箱盖也改成了碳纤维材质。
内饰部分也下了重本，整体上并没有改变原厂的布局，只是覆盖了全新的麂皮以及更轻的碳纤维门板。两张RECARO碳纤维桶椅身价不菲，红黑的搭配也凸显出Type R的味道。
虽然S2000原厂的液晶仪表已经足够漂亮，放到1999年也算是一个黑科技，不过和MoTec专用赛车电脑相比，还是后者更有现代化的气息。方向盘也改成了Momo的套件，这个方向盘也是NSX-R的原厂方向盘，不过就要舍弃掉原厂的安全气囊。