主动安全方面，ID.3还全系配备了Front Assist前部安全辅助系统和车道保持系统，在城市复杂道路状况下，提升行驶安全性。同时，E-CALL紧急救援、IQ. Light灵眸矩阵、Side Assist变道辅助系统、RCTA后部交通穿行系统等配置的加入，进一步增强了ID.3的主动保护能力。
一款安全的产品是不怕检验了，除了获得C-NCAP五星安全评价外，前不久ID.3还以全优成绩通过中国汽研新能源车60KM/H翻滚测试，测试中，ID.3放置在装载平台上，以60km/h的初始速度抛出，进行翻滚试验，同步对翻滚中假人受到的伤害进行采集评估。从车辆结构来看，ID.3整体车身结构保持完整，车顶与A柱、B柱和C柱均未出现断裂，座椅发生结构性失效，车门可正常开启。
前后贯穿式头部气帘加长至A柱，测试中在0.025秒内充满，及时、有效地扩大侧面保护面积，并在5秒内（从碰撞开始到翻滚结束）保持工作气压。智能安全带能够在0.01秒触发预紧，避免碰撞惯性带来的伤害。大众专利设计的头枕导杆前倾斜15.8°，碰撞发生时则可缩短驾乘人员头部和头枕之间的距离，大大减缓冲击。