从设计上看，大众ID.3基于MEB专属纯电平台打造，采用了大众ID.家族式前脸设计，并取消了中网。新车的前LED大灯采用圆形设计，外侧拥有蜂窝状结构。同时，新车加入了一条贯穿全新的大众车标连至两侧大灯组的LED灯带，并在灯组内部加入一个透镜。而在前包围处，新车还采用了横贯式进气格栅设计。并加入浮雕纹理元素进行点缀。另外，双色车身的设计以及相对活泼的车身配色，也让新车增色了不少。
车身侧面，作为一款纯电动车，新车采用了较为简洁的线条设计，其中，平直的上腰线从前翼子板铭牌处贯穿充电口盖延伸至尾灯组，营造出不错的光影效果。而在前翼子板和C柱处，新车还分别加入银色徽标和点状装饰，从而使得整个侧面看上去不至于太过单调。
车尾部分，新车同样采用了较为简约的设计，并且，虽然新车没有采用时下流行的的一体式尾灯设计，但是尾灯灯组采用了“倒P”样式的设计，整体视觉效果颇为前卫，此外，厚重的保险杠设计则有着经典的欧洲车风格。
车身尺寸方面，大众ID.3的长宽高分别为4261/1778/1568mm，轴距为2765mm。由于采用了短前后悬的设计，所以ID.3的车长尽管只有4261mm，但是它的轴距却达到了2765mm，其轴距已经超过了大多数紧凑型车，与同为紧凑型车的亚洲狮（2750mm）相比，还要多出15mm。因此，ID.3能够满足车内的乘坐空间需求。