近些年，国内消费者对车辆安全性方面尤为重视。曾经安全性是消费者购车选项的十名开外，而最近几年的一些调查中被频繁列入三甲。说起来，安全性却是看不见也摸不着的。对此，新一代林肯航海家对车辆的三个安全方面进行了升级。第一是车内空气安全，Auto Air Refresh座舱“新风管家”系统可时刻保持车内空气清新纯净。该系统采用四重过滤结构的高效活性炭过滤系统，能有效过滤94%的PM 0.3颗粒物，并能吸附多种有害物质，防止进入车内产生异味。同时，车内的蓝盾系统也可实时监测空气质量，让车内乘客有实时的量化感知并可做到智能切换内外空气循环。
第二便是主动安全方面，新一代航海家配有Co-Pilot 360TM 2.1智能辅助驾驶系统，带有iACC智能自适应巡航功能，可实现Stop & Go 自动跟车等功能，可以实现L2+级的智能辅助驾驶。同时PCA 防碰撞辅助系统、ESA 紧急避让辅助功能等功能可在危险发生前有效地预警提醒和保护车内成员。美国《消费者报告》针对市场主流的12种驾驶辅助系统，进行了5项全面且专业的安全测试，林肯获得全场最高评分，而一向以安全作为代名词的特斯拉和沃尔沃，分别位列第7和第11位。
第三便是被动安全层面，新一代航海家首次采用一体式门环结构，强度更高，守护更周到，整车340Mpa以上的高强度钢使用超63%，600Mpa以上超高强度钢应用超52%，1,300Mpa以上“潜艇级”热成型钢使用超32%。同时，林肯采用全球最严格的追尾标准88km/h来进行碰撞测试，其被动安全实力可见一斑。
相比奔驰GLC、沃尔沃XC60等竞品车型挤牙膏式的升级，新一代林肯航海家则是在动力、空间、舒适、智能、安全五大方面进行全方位升级，完全做到了碾压同级的存在，真正做到了本土化、国产化，打造适合“中浪”们的豪华座驾。