林肯星云人机交互系统提供了三种模式，包括全屏模式、协作模式和分屏模式。当驾驶员单人驾驶时，系统会自动进入全屏模式，而当副驾驶有乘客时，可选用协作模式或分屏模式。在协作模式下，车机系统会将主驾驶侧的操作界面镜像到副驾驶侧，副驾驶可在屏幕上协助主驾驶完成导航、车辆设置和音乐播放等操作。在分屏模式下，副驾驶可以进行分屏操作，在主驾驶查看导航的同时，副驾驶可以听音乐、看电影、屏幕投影等。
此外，大屏的操作也非常简单，一只手就能轻松完成。一指操作可点击滑动，二指操作可实现地图功能自如缩放，三指轻扫可实现分屏模式下屏幕间互通互联，四指左滑可将导航显示到仪表板上，五指收拢则可以返回主界面，整个操作简单易上手，还非常便利。
除了这些基本功能之外，该车机系统还有一些特殊模式。例如，当接待客人时，可以采用客人模式，在副驾驶侧播放欢迎页面，为客人创造宾至如归的感觉。此外，车主还可以设置特定驾驶路线并准备时空秘信，自定义惊喜信息和发布时间，为女友约会或上下班时制造属于两人的专属浪漫。