首先，三缸发动机存在明显的抖动问题。目前所有的发动机都采用四冲程工作原理，内部装有一根曲轴，活塞推动曲轴旋转。四缸发动机之所以没有抖动问题，是因为在工作时，1号气缸正好处于最高位置，而2号气缸处于最低位置，3号气缸又处于最高位置，4号气缸则处于最低位置。这种排列使得四个气缸的力互相抵消，减小了抖动。然而，三缸发动机只有三个气缸，因此无法完全抵消相互之间的作用力。尽管制造商在三缸发动机内部加入了平衡轴，但平衡轴的作用有限，三缸发动机仍然会出现明显的抖动问题。
其次，三缸发动机的油门响应较为迟钝。为了弥补三缸发动机对汽车性能的不利影响，一些制造商在车辆上安装了较大的飞轮。然而，这种做法虽然增加了发动机的惯性，但导致了变速器的响应变得迟钝。因此，许多车主在需要紧急加速或超车时，会感到油门反应迟钝。
此外，三缸车型的保值率较低。一些车企曾尝试推出三缸车型，但销量较差，最终被放弃。目前，二手车市场上的三缸车的保值率非常低，主要原因是大家对三缸车普遍持谨慎态度，尤其是关于抖动问题、油门响应迟钝和噪音较大等明显缺点。即使二手车交易商也对这类车型不感兴趣。