所谓的“变速箱生锈”集中于18款之前的老款车，准确的描述应当是“双离合器生锈”，导致车辆异响严重、启动困难和换挡障碍；这批福克斯使用的变速器是六档干式双离合器，此类离合器的特点是没有主动散热系统却容易高温，高频率的半联动的严重磨损不仅影响离合器总成的使用寿命，摩擦也会产生热能。而为了控制制造成本，离合器只设计出了“通气孔散热”，参考下图组。
干式双离合器只能依靠行驶中的风冷从通气孔进入来散热，通气孔则无法密封，过滤网的孔径也比较大；所以在下雨或者空气湿度太高的时候，发动机的飞轮和离合器都会容易生锈，严重生锈就会造成上述问题，而且异响是持续不断的。有相同问题的车辆还有大众奥迪等品牌的车辆，没有什么好的解决方法，只能等待出现问题后更换；福特在315点名该问题之前一直推诿，之后是否妥善解决也搞不清楚了。
此后的福克斯弃用了干式双离合变速器，全部改为8AT，三厢版本的8AT有“手自一体”的功能；变速器的问题算是解决了，但是全系使用三缸发动机的缺点又凸显了出来。没有任何技术可以解决三缸机怠速抖动的问题，即便是“双平衡轴”也只是降低抖动的程度罢了；因为三组气缸完全不同步的“四冲程”动作必然让机体无法平稳，加之三缸机较大的点火间隔角，转速稍低就会有明显的抖动感。