如果要走有积水的路段，需要关掉启停。原因是如果水很深，可能会导致发动机进水而熄火，一旦熄火了，在水中是不可以再次启动的，启动后会把连杆顶弯，缸体受伤，需要大修发动机，并且这种人为的损坏，保险公司也不会赔偿。而如果开着启停功能，熄火后可能会自动启动，带来不必要的损失。
另外，频繁使用启停，还会导致电瓶寿命缩短。启停车上用的电瓶与普通车用的不同，它能够适应短时间内大电流的充放电，因此价格也更高。一个普通电瓶四五百元，而一个启停电瓶上千元，且其寿命也比普通电瓶更短。所以如果不恰当的使用启停，不仅不会省油，还会因为频繁启动，缩短电瓶的寿命，过早更换电瓶造成额外的花费。
最后，有的人也不喜欢总是熄火再启动，感觉不舒服，也可以关闭，根据自己的喜好关闭或者打开。自动启停之所以设计了打开关闭开关，就是让我们要根据自己的用车环境，随时打开和关闭这个功能，以更合理的利用这个功能，最大程度的节省燃油减少排放。