摩托车坐三人会扣分。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》，摩托车载人不得超过其核定载人数，因此乘坐三人是不合法的。如果被交警查处，可能会面临扣分、罚款等处罚。此外，超载行驶也会增加安全隐患，建议遵守交通法规，确保行车安全。