ATM机通常只接受特定版本和格式的纸币存款。对于您提到的“1999年的100元”，一般来说，如果纸币的样式符合ATM机的接受标准，那么是可以存入ATM机的。但是，如果由于版本过旧或纸币损坏等原因导致不符合ATM机的要求，则可能无法存入。因此，建议您直接尝试将纸币存入ATM机来确认是否可以接受。如果ATM机不接受存款，您可以考虑前往银行柜台进行存款操作。