新车合格证扫不出来不一定代表车辆有问题。出现这种情况，可能是因为合格证二维码出现断裂或无法扫描的情况，此时可以联系经销商进行处理。如果合格证是伪造的，那么车辆可能存在问题，建议向经销商咨询并核实相关情况。另外，合格证是车辆的重要证件之一，在购买新车时应该仔细核对合格证上的信息是否真实且与车辆实际情况相符。如果合格证有问题，建议及时联系相关部门进行处理。