上海沪E蓝牌停发的原因主要是因为车辆牌照管理政策的调整。具体来说，可能是由于当地政策对于车辆注册和牌照发放有了新的规定，或者是为了缓解交通拥堵、控制车辆增长数量而采取的措施。建议您关注当地交通管理部门或相关政府网站的公告，以获取最准确和最新的信息。