三轮摩托车的三挡并不会伤害车辆。如果使用得当，三挡是正常的工作状态，不会对车辆造成损害。但是，如果经常用超过车辆能力的方式驾驶（比如高速行驶或者超负荷运载），那么任何档位都可能对车辆造成伤害。所以，正确的驾驶方式和维护车辆的正常使用是非常重要的。