是的，雅马哈125摩托车是可以进行长途行驶的。只要确保车辆性能良好、轮胎气压正常、油量充足以及必要的装备齐全（如头盔、护具等），就可以放心地进行长途旅行了。不过，由于排量较小，在连续长时间高速行驶的情况下可能会对发动机和传动系统造成一定的压力，因此建议适当休息以保护车辆。