因为上海市对进入市区的车辆有限制，其中就包括崇明岛的车牌。 根据《上海市非营业性客车额度拍卖管理规定》： 1. 外省市号牌车辆：禁止在本市绕城高速范围内（含）行驶。 2. 本市户籍人员、公安机关交通警察部门登记的在本市长期居住的外地人员，以及本市企事业单位的职工等，可以参加拍卖取得客车额度。 3. 未取得客车额度的，不得在本市绕城高速范围内（含）行驶。 4. 违反规定的，由公安机关交通警察部门责令改正，并处500元罚款。 所以，崇明岛的车牌不能进入上海市区的原因是因为政策限制。