是的，它会影响。如果你的摩托车没有进行年度检查或者错过了年度检查的截止日期，那么你的驾驶执照可能无法按时更换。这是因为在大多数地方，驾驶执照和车辆登记是相关的。如果车辆没有按照规定进行登记或检查，那么你的驾驶执照也可能受到影响。所以，如果你需要更换驾驶执照，但是你的摩托车还没有进行年度检查，你应该先处理这个问题。你可以联系当地的交通管理部门了解更多信息。