是的，会影响。如果你的摩托车驾驶证被扣满12分，那么你的C1驾驶证也将被吊销。因为按照中国的交通法规，一个人只能有且只能持有一个有效驾驶证，而你的摩托车驾驶证和C1驾驶证都属于汽车类驾驶证，所以一旦摩托车驾驶证扣分达到12分，你的C1驾驶证也就无法再使用了。你需要重新参加学习和考试才能恢复驾驶资格。